种子认证是依据种子认证方案，由认证机构确认并通过颁发认证证书和认证标识来证明某一种子批符合相应的规定要求的活动。通过上述活动生产出来的种子称为认证种子。
认证种子主要通过3方面的一系列活动来确认种子质量：一是通过对品种、种子田、种子来源、田间检验、清洁与不混杂管理、验证等一系列过程控制，确认种子的遗传质量（真实性和品种纯度）保持至育种家原先育出的状况和水平；二是监控种子扦样、标识和封缄行为符合认证方案规定的要求；三是通过种子检验室的检测，确认种子的物理质量（净度、发芽率等）符合国家标准或合同规定的要求。种子认证是依据种子认证方案，由认证机构确认并通过颁发认证证书和认证标识来证明某一种子批符合相应的规定要求的活动。通过上述活动生产出来的种子称为认证种子。认证种子主要通过3方面的一系列活动来确认种子质量：一是通过对品种、种子田、种子来源、田间检验、清洁与不混杂管理、验证等一系列过程控制，确认种子的遗传质量（真实性和品种纯度）保持至育种家原先育出的状况和水平；二是监控种子扦样、标识和封缄行为符合认证方案规定的要求；三是通过种子检验室的检测，确认种子的物理质量（净度、发芽率等）符合国家标准或合同规定的要求。
通过种子认证制度来控制种子的质量。种子认证制度（SeedCertified）就是对制种生产流程进行控制。各国认证制度大同小异，但都是由官方机构或者官方认可的机构，从种子生产开始就对各个环节进行监控。生产的是哪个品种？品种的来源？种植面积多大？在什么地方种植？全部记录在案。在生产过程中，对生产种子的质量监督管理，对生产种子的数量进行估算。最后只对符合质量标准的种子发放认证标签（CertifiedTag），标签的数量与实际种子产量一致。贴于种子袋上的种子标签起证明种子基因纯度、审定等级和种子质量的作用。标签上注明种子审定机构、种子批号、种子的种类（种名、品种名）、审定种子等级、种子生产者的登记号和统一的编号。更多内容：https://baike.baidu.com/item/种子认证/1855445
1995年9月，时任国务院副总理姜春云同志在实施“种子工程”第一次工作会议上明确指出，要“逐步建立健全种子质量认证制度”。随后，原农业部党组研究决定开展农作物种子质量认证试点工作，纳入全国“种子工程”的重要内容加以实施。1996年原农业部印发《关于开展种子质量认证试点工作的通知》，全国农业技术推广服务中心组织实施了1996-2005年连续10年的试点工作，做了大量的试验和探索，积累了一些有益的经验。
2015年修订的《中华人民共和国种子法》第五十二条规定，种子生产经营者可自愿向具有资质的认证机构申请种子质量认证。经认证合格的，可以在包装上使用认证标识。
经济合作与发展组织（OECD）是国际种子认证组织，其种子认证始于1958年，宗旨是鼓励参加国持续使用高质量种子。2018年OECD种子认证已有61个成员国，认证内容涉及8个种子认证方案。
国际种子检验协会（IS-TA）是制定国际种子检验规程和手册、实验室认可、质量保证和发放国际检验证书的组织。ISTA与OECD有密切的联系和合作。参与种子认证活动，且ISTA国际证书伴随着国际贸易的所有OECD认证的种子。