为进一步巩固商品有机肥推广成果，将农民科学用肥提高耕地质量，改善上海地区农业生态环境，市农委对我市种植蔬菜的农业生产组织（合作农场、专业合作社），企业和农户，施用商品有机肥，每吨补贴200元，根据不同作物施用标准确定施用量，每亩最高不超过一吨，各区县财政可根据实际情况安排配套资金。
商品有机肥补贴实行申报制，用户单位（个人）于上年8月底向所在地村民委员会（或乡镇农业部门）申报年度需求，申报时需提供作物种类，种植面积，肥料需求量等。村民委员会（或乡镇农业部门）审核汇总后，逐渐上报至区县农委。市农委对区县上报数字审核后，列入下年度部门预算，并在年初将当年有机肥补贴计划下达至各区县和市有关单位。