上海交通大学农业与生物学院的前身是上海农学院，创办于1959年。1999年9月，有着40年历史的上海农学院并入上海交通大学，成立了上海交通大学农学院，2002年3月更名为上海交通大学农业与生物学院。
学院下设植物科学系、动物科学系、园林科学与工程系、资源与环境系、食品科学与工程系共5个系；设有现代农业技术教育培训中心、实验与实践教学中心、现代农业技术推广服务中心、食品安全与营养研究平台、公共仪器服务平台；拥有挂靠学院的“上海交通大学新农村发展研究院”、“交大-复旦-诺丁汉植物生物技术研发中心”、“上海交通大学陆伯勋食品安全研究中心”等部门。学院拥有上海市重点学科5个（作物遗传育种、兽医传染病与预防兽医学、农艺学、园林学、蔬菜学）；拥有农业部都市农业（南方）重点开放实验室、科技部注册的中美食品安全联合研究中心、上海市兽医生物技术重点实验室、上海食品安全工程技术研究中心。学院现有教职工215人，其中专任教师133人，教师中，具有正高职称的教师48人，具有博士学位的教师占114人，海外博士25,具有一年以上海外学习经历的教师占74人。现拥有“长江学者奖励计划”特聘教授1人，中组部千人计划获得者3人，校讲席教授6人,中组部青年千人计划获得者1人。
学院现有5个本科专业（植物生物技术、动物生物技术、资源环境科学、园林、食品科学与工程）；有14个二级学科硕士学位点（蔬菜学、果树学、植物病理学、农药学、动物营养与饲料科学、动物遗传育种与繁殖、草业科学、食品科学、预防兽医学、园林植物与 观赏园艺、作物遗传育种学、生态学、植物学、农业工程）和4个硕士专业学位点（农业推广、兽医推广、风景园林、食品工程）；有7个一级或二级博士学位点（园艺学、环境科学与工程、生物技术、预防兽医学与畜禽产品安全、植物学、生态学、食品冷藏工程）；拥有蔬菜学博士后流动站。截至2012年9月，在校本科生565人、硕士研究生240人（其中学术型研究生153人、全日制专业学位研究生87人）、博士研究生167人。
学院围绕农业生物技术、都市现代农业、食品科学与营养三大板块凝练学科，在七大领域逐步形成自己的特色和优势。学院明确了“以应用基础研究为主，向两头延伸”的科研定位，国家级项目立项、科研经费保持快速增长，近三年来，科研经费2.1亿元；获教育部科技进步一等奖2项、二等奖3项、上海市科技进步三等奖2项；发表SCI收录论文371篇、EI收录论文55篇，专利受理282项，专利授权155项，品种审定24项。
学院始终把交流与合作作为提升办学质量、实现跨越式发展的重要途径。除了广泛开展国内的交流合作外，还与美、英、法、德、日等国家的30多个知名学校和科研机构建立了良好的合作关系，自2005年起，学院与全球农科排名第一的美国康奈尔大学农业与生命学院形成战略伙伴并展开全面合作。
学院贯彻人才强院战略、交叉集成战略、国际化战略和社会服务战略，坚持科学发展观，探索综合性大学农科发展道路；吸取国外先进办学思想，提升学院办学理念；坚持“有所为、有所不为”的原则，凝练学科梯队，有选择地发展强势学科，构建创新平台，努力实现跨越式发展。学院的目标是瞄准国际未来农业科学发展趋势，参照国家和上海市中长期科技发展总体规划，通过体制创新与学科交叉，聚焦农业生物技术、都市现代农业和食品安全与营养，建成综合性大学的一流农科，成为中国现代农业的教学、科研、社会服务和人才培养的国内高水平农科院校之一。
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