《意见》提出，南繁科研育种保护区纳入基本农田进行永久保护，结合农村土地承包经营权确权登记颁证工作，将保护区耕地明确到具体农户，落实到具体田块，耕地整体纳入高标准农田建设范围。按照三亚片、乐东片、陵水片，及现有基地区、新建基地区，“三片两区”的整体布局，规划建设5.3万亩南繁科研育种核心区。
《意见》还提出，构建政府引导、企业运作的市场化服务机制和多元化投入机制。对成建制规模化提供南繁科研育种基地的村委会给予支持，优先安排供地农民用工。鼓励具备条件的种子企业上市募集资金。大力支持“育繁推一体化”种业龙头企业发展，支持建设种质资源库，引进国内外先进的育种技术，培育具有自主知识产权的突破性优良品种。
在承担国家救灾备荒种子储备任务的基础上，海南省要建立省级救灾备荒种子储备，重点储备水稻、瓜菜为主的大宗作物种子，保障灾后恢复生产和市场调剂。